Муниципальное бюджетное образовательное учреждение средняя общеобразовательная школа №16 была открыта в 1950 году. Школа начала функционировать как восьмилетняя по ул.Набережная. С 1963 года она преобразована в среднюю школу. В августе 1971 года средняя школа переведена в новое здание по ул. Куйбышева-258, в котором располагается в настоящее время.

Учредителем школы является Управление образования Администрации города Димитровграда.